碳青霉烯類抗菌藥物一直是產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺 酶(ESBLs)或 AmpC 酶的腸桿菌科細(xì)菌治療首選藥 物,也被認(rèn)為是最后的防線 。隨著該類抗菌藥物 的 廣 泛 使 用 ,臨 床 耐 碳 青 霉 烯 類 腸 桿 菌 科 細(xì) 菌 (CRE)菌株對碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥率逐年升 高,這在很大程度上限制了該類抗菌藥物的使用,造 成了藥物使用的困難 。
1 材料與方法
1. 1 菌株來源
收集 2018 年 1—12 月重慶市某三
甲醫(yī)院臨床分離的非重復(fù)腸桿菌科細(xì)菌1 202株。陽
性對照菌株為 5 株重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院分離
的碳青霉烯酶基因陽性肺炎克雷伯菌,包括 bla KPC-2、
bla IMP-1、bla VIM-2、bla NDM-1和 bla OXA-48 5 種基因型,陰性對
照菌株為實驗室保存的標(biāo)準(zhǔn)菌株大腸埃希菌 ATCC
25922。
1. 2 儀器與試劑
儀器:VITEK-MS 質(zhì)譜儀和 VITEK-2 Compact 全自動微生物鑒定藥敏儀(均為法
國生物梅里埃公司生產(chǎn)),GNP29270 型恒溫培養(yǎng)箱
(上海精宏實驗室設(shè)備有限公司生產(chǎn)),CFX96 熒光
定量 PCR 擴增儀和 Bio-Rad ChemiDoc XRS 凝膠成
像系統(tǒng)(均為美國 Bio-Rad 公司生產(chǎn)),BG-subMIDIv)可見光電泳—透射儀(北京百晶公司生產(chǎn))。試
劑:血瓊脂平皿購于英國 OXOID 公司,VITEK-MS
CHCA基質(zhì)液購于法國生物梅里埃公司,Premix Taq?
酶和 DNA Marker 均購于大連寶生生物公司,5 種基
因的引物由重慶擎科興業(yè)生物技術(shù)有限公司合成。
1. 3 CRE 菌株鑒定及藥敏試驗
將 61 株 CRE 菌株
均經(jīng) VITEK-MS 質(zhì)譜儀鑒定到種,再通過 VITEK-2
Compact 進(jìn)行藥敏試驗,并用最小抑菌濃度(MIC)法
測定其對 14 種常用抗菌藥物的敏感性,參照 2018 版
CLSI-M100 標(biāo)準(zhǔn)判讀結(jié)果,本研究將對亞胺培南耐
藥的腸桿菌科細(xì)菌定義為 CRE,并對各種抗菌藥物
耐藥率進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
1. 4 檢測 CRE 菌株的碳青霉烯酶基因
(1)模板
制備:CRE 菌株 DNA 采用煮沸法提取,放-20 ℃冰箱
保存?zhèn)溆?。?)碳青霉烯酶基因的 PCR 檢測:以 CRE
菌 株 DNA 為 模 板 分 別 對 bla KPC-2、bla IMP-1、bla VIM-2、
bla NDM-1 和 bla OXA-48 5 種基因型進(jìn)行 PCR 擴增,反應(yīng)
條件參照進(jìn)行。PCR 反應(yīng)體系
為 25 μL,包括 12. 5 μL Taq PCR Master Mix,2 μL 上
下游引物,1 μL DNA 模板,9. 5 μL ddH2O。PCR 反應(yīng)
條件為先 94 ℃預(yù)變 5 min,再 94 ℃變性 30 s,55 ℃退
火 30 s,72 ℃延伸 30 s 或者 60 s(具體根據(jù)產(chǎn)物長度
而定);變性、退火、延伸 30 個循環(huán);最后 72 ℃繼續(xù)延
伸 7 min。將 PCR 擴增產(chǎn)物置于 2. 0%瓊脂糖凝膠電
泳25 min,然后再通過凝膠成像儀觀察結(jié)果。(3)碳
青霉烯酶基因測序:將 PCR 擴增陽性的產(chǎn)物送深
圳華大生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,將測序所得
的序列與 GenBank 核酸數(shù)據(jù)庫進(jìn)行 BLAST 序列比
對,將相似度最高的基因型作為待測細(xì)菌的基因
類型。
1. 5 統(tǒng)計學(xué)方法
采用 WHONET 5. 6 軟件進(jìn)行統(tǒng)
計分析。
2 結(jié) 果
2. 1 CRE 菌株鑒定及藥敏試驗結(jié)果
采用 WHONET 5. 6 軟件對藥敏資料進(jìn)行統(tǒng)計分析,分離得到61 株 CRE 菌株,其中肺炎克雷伯菌 51 株(83. 6%)、
陰溝腸桿菌 6 株(9. 8%)、大腸埃希菌 4 株(6. 6%),
61 株 CRE 菌株的科室及種類分布;同時,藥
敏結(jié)果顯示,61 株 CRE 菌株對 14 種抗生素的耐藥率
分別為亞胺培南(100. 0%),氨芐西林/舒巴坦(100. 0%),
頭孢曲松(100. 0%),頭孢他啶(100. 0%),頭孢替坦
(91. 5%),頭孢吡肟(93. 9%),哌拉西林/他唑巴坦
(91. 5%),氨曲南(95. 5%),復(fù)方新諾明(81. 3%),慶
大霉素(81. 3%),妥布霉素(73. 2%),環(huán)丙沙星(79. 3%),
左旋氧氟沙星(58. 5%),阿米卡星(57. 7%),61 株 CRE
菌株對臨床常用抗生素呈高度耐藥,除了對左旋氧
氟沙星和阿米卡星的耐藥率低于 60.0%,對大部分抗
生素的耐藥率都大于80.0%。
2. 2 碳青霉烯酶基因檢測結(jié)果
61 株 CRE 菌株中
共檢測出 bla KPC-2 基因型 50 株,bla NDM-1 基因型 9 株,
bla OXA-48基因型4株,未檢測出bla IMP-1基因型和bla VIM-2
基因型。
3 討 論
腸桿菌科細(xì)菌作為社區(qū)和院內(nèi)感染的重要病原
菌,可引起呼吸道、尿路以及菌血癥等各種部位的感
染。碳青霉烯類抗菌藥物對大多數(shù)產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰
胺酶和質(zhì)粒介導(dǎo)的 AmpC 酶具有較高的穩(wěn)定性,是
目前治療革蘭陰性菌抗菌譜最廣、抗菌活性最強的
一類抗菌藥物。但是隨著該類藥物大量使用甚至過
度治療,臨床耐藥現(xiàn)象已在腸桿菌科細(xì)菌中開始出
現(xiàn),并呈逐年增加趨勢,且耐藥范圍已從歐洲、北美
等地區(qū)擴大到中國,菌種也擴展至多種不同種屬的
腸桿菌科細(xì)菌 。2018 年全院共
分離出 61 株 CRE 菌株,其中耐碳青霉烯類肺炎克雷
伯菌 51 株,占 83.6%,說明該院主要感染 CRE 菌株呈
優(yōu)勢性病原菌感染流行趨勢,這與 CHINET 中國細(xì)
菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)統(tǒng)計結(jié)果基本一致。該情況仍值得
臨床密切關(guān)注并采取有效的控制措施,避免重復(fù)給
藥、超適應(yīng)證給藥等錯誤行為的發(fā)生。
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